Помимо звука в таймлайне наличествуют также видеотреки.
Пробовал:
1. Убирать видео треки и проигрывать в таймлайне одну аудиодорожку.
2. Всячески переконвертировал звук в WAV с самыми различными настройками (в том числе и с совпадающеми с настройками аудио самого проекта и видео-клипов).
Результат тот же.

Premiere Pro 1.5
Проект PAL 1.067, 4:3, аудио 48К стерео 16bit.