1. Ты должен для себя уяснить, что в ФК на таймлайне клипы ко времени не привязываются. Я обычно в начале каждой секвенции вставляю маленький GAP (дырка)(Edit-Insert Generator-Gap) по умолчанию он 5 сек, подрезаешь, сколько надо. К нему так же, как и к клипу, можно привязать что угодно (др. клип, титры, сторилайн и т.д.), его бывает вставляю в середине секвенции, если нужно сделать "паузу", это так же инструмент для того же сторилайн, например состоящего из нескольких титров, но межу должна быть дырка, и т.д. и т.п.
2. У тебя есть в секвенции основная линейка (или как они ее там называют) , она может состоять из видео клипов, титров, футажей и т.д., к ней привязывается все остальное (наложения, титры, музыка). Если ты выделишь на этой линейке несколько клипов и применешь Lift from Storylain , оно подвинет их вверх, а на основной сделает GAP. Из этой основной, ты можешь сделать компауд, если уверен, что оно готово, к нему применять любую обработку (применится ко всем клипам), накладывать звуки, титры, рамки и т.д. , но должен знать, что если чего то поправить надо в этом компауд, то по клику, откроется в новом окне. В крайнем случае, компауд всегда можно раскампаудить (Clip - Break Apart Clip Items).
3.Если ты на основной удаляешь клип, удалятся все привязанные к нему, ибо привязываться не к чему, или читай п1
И что бы тут не потерять привязанные титры, музыку, или еще что, их надо привязать к другому (передвинуть), или через копи-пасте, или сделать на основной гап и т.д., вариантов много.
4. Ты можешь спокойно в этой программе открывать в бине кучу проектов (Library) и спокойно между ними через копи-пасте обмениваться практически всем, клипами, музыкой, компаудами, эффектами, обработкой....Просто и удобно.
Вот это в принципе принцип построения, врубись, и все получится, потому что остальное дело техники.